撰写:生信大师姐 来源:小张聊科研平台的xg111企业邮局“ i生信”公众号苹果版死亡细胞吧下载,微信公众号搜索“ i生信”即可关注/扫描关注见文末
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铁死亡是太平洋在线xg111由铁依赖的脂质过氧化作用驱动的细胞程序性死亡方式,作为细胞死亡家族的明星成员,不管是机制研究中的细胞表型选择,还是生信发文中的科研热点选择,铁死亡都是热门选手苹果版死亡细胞吧下载。工欲善其事必先利其器,做铁死亡研究离不开铁死亡相关数据库的支持,第一个铁死亡相关数据库FerrDb V1(年发表。
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为了太平洋在线手机版跟上铁死亡研究的快速进展,并提供及时和高质量的数据,该数据库进行了升级,所以有了我们今天要介绍的FerrDb V2(/)苹果版死亡细胞吧下载。
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数据库收录信息
该数据库收录了1001个铁死亡调节因子和143个铁死亡-疾病关联苹果版死亡细胞吧下载。其中,驱动基因有264个,抑制基因有238个,标记基因有9个,未分类基因有110个;物质调节剂有380种,其中诱导剂有201种,抑制剂有179种。
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与 V1版本相比,V2版所收录的文章增加了300%,铁死亡调节因子增加了175%,铁死亡-疾病关联增加了50.5%苹果版死亡细胞吧下载。V2版本新增了环状RNA和假基因类型的调节因子,非编码RNA的比例从7.3%增加到13.6%。
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数据下载
假如你想获取铁死亡相关调节基因列表或物质调节剂列表,该数据库提供了非常友好的下载途径:download页面选择即可下载苹果版死亡细胞吧下载。
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下载的文件格式如下,可以根据基因类型标识符进行筛选苹果版死亡细胞吧下载。
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PS:作者在该数据库上也提供了铜死亡相关基因的下载途径(详见绿色框框),铜死亡是去年Science上刚刚发表的,且同样是金属离子介导的细胞死亡方式,这算不算是铜死亡的第一个数据库(笑cry)苹果版死亡细胞吧下载。
数据库使用指南
在“Browse”界面,可以对感兴趣的调节基因或物质调节剂进行检索(可以选定调节类别后选基因,也可以直接检索目标基因)苹果版死亡细胞吧下载。检索结果包含调节基因或物质调节剂的详情介绍,以及对应的文献来源。
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除此之外,在“Browse”界面的最下方可以看到该数据库还提供了基础的在线分析功能,可以快速实现在公共数据库中探究目标基因在不同细胞系/组织部位/疾病的表达水平及对不同疾病的预后影响,以及相关药物苹果版死亡细胞吧下载。
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在“Utilities”界面则进一步提供了调控网络/富集分析/相关性分析/差异分析相关的在线分析小工具,几乎涵盖了铁死亡相关基因的基础分析类型,避免了再去其他数据库进行基础分析的麻烦苹果版死亡细胞吧下载。
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